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小分子核酸染料与GelRed和SafeRed的电泳胶图对比
时间:2020-06-05作者:富百科原创--转发本文请注明出处!


SafeRed®, DuRed®和DuGreen®为北京富百科生物技术有限公司注册商标,未经授权严禁使用!富百科原创--转发本文请注明出处!

一、量子化学计算显示核酸染料分子量只有在600以上(不含对阴离子),才能确保染料无法通过细胞膜,才能确保染料无法插入DNA双链内引起突变。市面上冒充安全染料Super GelRed(本网站简称GelRed)的小分子核酸染料(染料母体分子量小于600)主要有溴化乙啶EB(染料母体分子量314),碘化丙啶PI(染料母体分子量414),磺化丙啶PS(染料母体分子量407),这些分子极有可能和EB一样对生殖细胞致突变性!

二、Sigma-Aldrich的MSDS显示碘化丙啶PI与EB一样对生殖细胞致突变性(类别2:H341)!

三、以下是这些小分子染料和SuperGelRed以及SafeRed的电泳胶图对比,请大家对比参考!我们公司提供免费的质谱鉴定和琼脂糖核酸电泳鉴定服务。

1. EB是世人皆知的小分子,强烈的诱变剂/致癌物/致畸物,EB因为是小分子很快跑出胶外,所以EB容易导致小DNA片段看不清;EB会导致胶的整体背景稍微高些,经常出现阴阳背景(胶的背景一部分亮一部分暗)

2. PIEB一样是小分子的强烈的诱变剂/致癌物/致畸物,PI因为也是小分子很快跑出胶外,所以PI也容易导致小DNA片段看不清,有时出现阴阳背景。PI中碘含量占分子量的40%,碘离子本身就是很强的荧光淬灭剂,高含量碘离子淬灭荧光导致DNA条带的亮度灵敏度远低于EB

3. PSEB一样是小分子的强烈的诱变剂/致癌物/致畸物,分子整体呈中性,与DNA结合能力弱,DNA条带最弱;并且大部分PS染料没有与DNA结合留在琼脂糖凝胶中,胶的背景最亮。

4. GelRed分子量大于1000,确保染料无法通过细胞膜,确保染料无法插入DNA双链内引起突变,没有EB类似的诱变性。通过荧光共振增强了亮度和灵敏度,但是GelRed是不饱和染料,大片段DNA条带易拖尾模糊。

5. 第三代安全核酸染料SafeRedGelRed一样分子量大于1000,确保染料无法通过细胞膜,确保染料无法插入DNA双链内引起突变,没有EB类似的诱变性。通过荧光共振大大增强了亮度和灵敏度,同时SafeRed通过本公司自主知识产权饱和染料的独特设计,完全改善了GelRed对大片段DNA拖尾模糊的严重缺陷,SafeRed的所有DNA电泳条带条带清晰整齐美观,并且亮度高/灵敏度高。完美改善了GelRed缺点。

胶图对比.jpg

电泳条件:1%琼脂糖凝胶,恒压130V电泳30min;样品为DL2000 Marker,上样量为3uL5uL;    

电泳观测:凝胶成像仪Tanon-4600SF302nm观测电泳结果;曝光时间为100~120毫秒。


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