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小分子核酸染料与GelRed和SafeRed®的电泳胶图对比
时间:2020-06-05作者:富百科原创--转发本文请注明出处!


SafeRed®为北京富百科生物技术有限公司注册商标,未经授权严禁使用!富百科原创--转发本文请注明出处!

一、富百科实验显示核酸染料分子量在800以上(不含对阴离子),使染料很难通过完整的细胞膜,大分子的染料远超过DNA双螺旋间的尺寸,使其难以插入DNA双链内从而可能引起突变。小分子核酸染料(染料母体分子量小于500)主要有溴化乙啶EB(染料母体分子量314),碘化丙啶PI(染料母体分子量414),磺化丙啶PS(染料母体分子量407),这些分子有可能和EB一样对生殖细胞致突变性!参考文献:卫生研究-2020-49(6)-938

二、Sigma-AldrichMSDS显示碘化丙啶PIEB一样对生殖细胞致突变性(类别2: H341 怀疑可造成遗传性缺陷)!

三、以下是这些小分子染料和10000x GelRed以及SafeRed的电泳胶图对比,请对比参考!以下是这些小分子染料的结构式和质谱数据, 我们公司提供免费的质谱鉴定和琼脂糖核酸电泳鉴定服务。参考文献:卫生研究-2020-49(6)-938

1. 溴化乙啶EB是小分子并且是强烈的诱变剂/致畸物,类别2: H341 怀疑可造成遗传性缺陷EB因为是小分子很快跑出胶外,所以EB容易导致小DNA片段看不清;EB会导致胶的整体背景稍微高些,经常出现阴阳背景(胶的背景一部分亮一部分暗

2. 碘化丙啶PIEB一样是小分子的强烈的诱变剂/致畸物,类别2: H341 怀疑可造成遗传性缺陷PI因为也是小分子很快跑出胶外,所以PI也容易导致小DNA片段看不清,有时出现阴阳背景。PI中碘含量占分子量~40%,碘离子本身就是很强的荧光淬灭剂,高含量碘离子淬灭荧光导致DNA条带的亮度灵敏度远低于EB

3. PS的分子量EB以及PI相差无几,分子整体呈中性,与DNA结合能力弱,DNA条带亮度更弱背景更高;并且大部分PS染料没有与DNA结合留在琼脂糖凝胶中,胶的背景最亮。

4. 富百科第二代核酸染料10000x GelRed分子量大于1000,确保染料难以通过完整活细胞膜,确保染料难以插入DNA双链内引起突变。通过荧光共振增强了亮度和灵敏度,但是10000xGelRed是不饱和染料,大片段DNA条带易拖尾模糊。

5. 相对安全:药名康德Ames-test实验显示在凝胶染色浓度下SafeRed没有EB和PI类似的诱变性!富百科第三代核酸染料SafeRed与第二代10000xGelRed都是分子量大于1000。SafeRed通过荧光共振能量转移FRET的独特设计,增强了亮度和灵敏度并大大改善了10000xGelRed对大片段DNA拖尾模糊的严重缺陷(如下图所示),SafeRed的DNA电泳条带条带清晰整齐美观,并且亮度高/灵敏度高。改善了10000x GelRed缺点。参考文献:卫生研究-2020-49(6)-938胶图对比.jpg

电泳条件:1%琼脂糖凝胶,恒压130V电泳30min;样品为DL2000 Marker,上样量为3uL5uL;    

电泳观测:凝胶成像仪Tanon-4600SF302nm观测电泳结果;曝光时间为100~120毫秒。


以下是这些小分子染料的结构式和质谱数据,请对比参考! 我们公司提供免费的质谱测试服务,只须1uL样品!

小分子核酸染料质谱.jpg



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