用于 dsDNA 定量检测的FBGreen荧光染料 (~PicoGreen)
1.应用说明
在分子生物学的试验过程中,FBGreen dsDNA 定量试剂盒是荧光检测双链 DNA 并进行定量 的一种产品,这种方法非常灵敏。常用于分子生物学技术中的:cDNA 文库的构建;用于亚克隆的 DNA 片段纯化及应用,比如进行 DNA 定量、产物扩增和引物的进一步检测。 疫苗是现代疾病预防中常用的控制方式。如今许多疫苗是细胞培养疫苗,比如重组乙肝疫苗、狂犬病疫苗等大多数疫苗都采用细胞培养的方法生产。其中,疫苗的纯化是关键问题,我们需要尽可能的去除宿主细胞DNA和宿主蛋白。假若宿主细胞的DNA和蛋白同疫苗一起注入人体将会产生不可预料的后果。
常规的DNA含量的检测方法是在260nm(A260)处测其吸光值。这种方法的主要缺点是核苷酸、单链核酸和蛋白质对信号的影响很大,并且还会受到核酸制备过程中污染物的干扰,无法区分DNA和RNA,而且这种方法不灵敏(5μg/mLdsDNA溶液A260=0.1)。PicoGreen定量检测方法简单、方便,被多家生物制品厂所选择,成为生物制品残留DNA检测的标准。目前该方法已纳入2010年版《中国药典》
原理:
FBGreen与DNA双链结合后才发出的荧光,无DNA不发荧光;所发荧光与DNA浓度成正比。在2010年《中国药典》中提出,FBGreen定量DNA的方法检出限约0.3ng/ml,DNA含量在1.25-80ng/mL范围时线性较好(R2>0.99).
优点:
1)该方法可以测定来源于任何表达宿主样品中的双链DNA。
2)可以直接定量PCR扩增产物而无需从反应混合物中纯化DNA。
3)远远超出传统紫外A260的检测方法和Hoechst33258的灵敏度。
4)较高浓度的盐,尿素,乙醇,氯仿,去垢剂,蛋白或琼脂糖对测定无影响。
5)在等摩尔浓度 ssDNA 和 RNA 存在的条件下测定 dsDNA,其影响很小。
2.所需器材
• 微型荧光计;便携式荧光仪-上海互帼科学仪器有限公司HG-9型;1cm石英比色皿
• FBGreen dsDNA 定量检测试剂盒, 1mL 单位量的试剂浓缩液足够 2mL 体积的 200 次测定。
1×TE(10mM Tris 1mM EDTA)pH8.0; 250ug/mL Sigma 小牛胸腺DNA
3.实验方案
试剂制备
FBGreen dsDNA 定量试剂是以 1mL 的浓缩液形式保存在无水的 DMSO(二甲基亚砜)中。实 验当天,配制 2XFBGreen 试剂的操作溶液,用 1xTE 按 1:200 的比例稀释浓缩液(10mM Tris-HCl,
1mM EDTA,pH7.5)。如果要准备足够的操作溶液测定 20 个样品,可在 20mL1x TE 中加入 100μL FBGreen dsDNA 定量试剂。由于试剂容易吸附到玻璃表面,要在塑料容器中配制。PicoGreen 试剂 见光易降解,所以应将配好的溶液用箔包住或放置暗处避光保存。
溶液最好在配制好数小时内使用,以保证最佳结果。
实验方法:
1). 标准品工作液的配制:
Sigma小牛胸腺嘧啶DNA干粉(货号:D4522-1MG)1mg(Tris,Nacl等浓度已成标准体系),加入1mL双蒸水,配制成1mg∕mL的标准品工作液;
2). 染料工作液的配置:
6 uLFBGreen加入1mL TE(注意:用1×TE将FBKGreen稀释200倍,现用现配,注意避光)。
3). 标准品工作液稀释:
(1)母液稀释:取10ul(1mg∕mL)标准品工作液加入到990ul TE溶液中,浓度稀释成10ug∕mL,取10ul(10ug∕mL)标准品工作液加入到990ul TE溶液中,浓度稀释成100ng∕mL;
(2)倍比稀释:取800ul (100ng∕mL)的标准品工作液加入到200ul TE溶液中,浓度达到80ng∕mL(药典规定:荧光染色方法DNA含量在1.25-80 ng/mL范围线性较好, 该法DNA检出限为0.3 ng/ml),取500ul(80ng∕mL)的标准品工作液加入到500ul TE溶液中,浓度稀释到40ng∕mL;依次倍比稀释,配成20ng/ml、10ng/ml、5.0ng/ml、2.5ng/ml、1.25ng/ml、0.625ng/ml的标准品溶液;
4).标准曲线的制备:倍比稀释后的各梯度标准品溶液和染料工作液各取100ul混匀,避光室温放置5min。使用FB-15型便携式荧光仪检测样品的荧光值:将混合后的溶液加入微量比色皿,确信不要在样品中引入气泡,轻轻地弹微量检测皿的外部,可以驱散气泡。以1×TE缓冲液为blank,测定样品和空白对照的荧光值;用标准品溶液的浓度(ng/ml)对应的荧光强度作直线回归,制备标准曲线。
待测DNA最终浓度 (ng/ml) | 荧光读值 |
100 | 6210 |
50 | 3195 |
40 | 2507 |
20 | 1261 |
10 | 620.8 |
5 | 298 |
4 | 258.8 |
2 | 152 |
0.5 | 43.8 |
0 | 0.72 |
5). 测量剩余样品的荧光值。荧光计将给出一个直接的浓度读数,数据可以用来产生DNA 浓度的标准曲线。
特别提醒:
1) 本公司所有产品仅限于专业人员用于生命科学研究,不得用于临床诊断或治疗,不得用于食品或药品,不得存放于普通住宅!
2) 本公司所有产品必须由合格专业技术人员操作同时佩戴口罩/手套/实验服并遵守生物实验室安全操作规程!
Name | FBGreen dsDNA for Qubit定量检测试剂盒(~PicoGreen) | ||
---|---|---|---|
CAT# | 015-1mL; 015-0.1mLx10 | CAS# | N/A |
Storage# | -20°C Sealed & desiccated & Minimized light exposure & Minimized Freezing And Thawing! | Shelf Life# | 24 months |
Ex(nm)# | 488 | Em(nm)# | 520 |
MW# | N/A | Solvent# | DMSO |
Name | FBGreen dsDNA for Qubit定量检测试剂盒(~PicoGreen) |
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CAT# | 015-1mL; 015-0.1mLx10 |
CAS# | N/A |
Storage# | -20°C Sealed & desiccated & Minimized light exposure & Minimized Freezing And Thawing! |
Shelf Life# | 24 months |
Ex(nm)# | 488 |
Em(nm)# | 520 |
MW# | N/A |
Solvent# | DMSO |